Cardiopatías Congénitas
Panel de Cardiopatías Congénitas [114 genes]: se debería considerar la utilización de este panel:
- En el caso de cardiopatía congénita aislada.
- En el caso de cardiopatía congénita sindrómica relacionada con genes incluidos en el panel.
- En el caso de que se hayan descartado otras causas de cardiopatías congénitas (la presencia de anomalías cromosómicas, por ejemplo) mediante otro método, como SNP-arrays.
ACTA2 | ACTC1 | ACVR1 | ACVR2B | ACVRL1 | ANKRD1 | B3GAT3 | BMPR2 | BRAF | CBL |
CFC1 | CITED2 | COL1A1 | COL1A2 | COL3A1 | COL5A1 | COL5A2 | CREBBP | CRELD1 | CHD7 |
DTNA | EFEMP2 | EHMT1 | ELN | ENG | EP300 | EVC | EYA4 | FBN1 | FBN2 |
FLNA | FOXC1 | FOXF1 | FOXH1 | FOXP1 | GAA | GATA4 | GATA5 | GATA6 | GDF1 |
GJA1 | GJA5 | HAND2 | HRAS | IRX4 | ISL1 | JAG1 | KANSL1 | KCNA5 | KCNJ8 |
KCNK3 | KMT2D | KRAS | LEFTY2 | MAP2K1/MEK1 | MAP2K2 | MCTP2 | MED12 | MED13L | MFAP5 |
MIB1 | MYBPC3 | MYH11 | MYH6 | MYH7 | MYLK | NEXN | NF1 | NKX2-5 | NKX2-6 |
NODAL | NOTCH1 | NOTCH2 | NOTCH3 | PHP4 | NRAS | PDGFRA | PITX2 | PLOD1 | PRKG1 |
PTPN11 | RAF1 | RASA1 | RASA2 | RIT1 | SALL4 | SHOC2 | SKI | SLC2A10 | SMAD1 |
SMAD3 | SMAD4 | SMAD6 | SMAD9 | SOS1 | SOS2 | SPRED1 | TAB2 | TBX1 | TBX20 |
TBX5 | TDGF1 | TFAP2B | TGFB2 | TGFB3 | TGFBR1 | TGFBR2 | TNNI3 | TNNI3K | TOPBP1 |
UPF3B | ZDHHC9 | ZFPM2 | ZIC3 |
Panel general de Enfermedades Cardiovasculares [405 genes]: este panel incluye todos los genes asociados o potencialmente asociados al desarrollo de enfermedades cardiovasculares hereditarias, al igual que genes que se asocian a un mayor riesgo cardiovascular global. Se trata de un grupo de enfermedades heterogéneas, y el estudio genético permite el diagnóstico diferencial entre las mismas. También es de utilidad cuando se sospecha una etiología multigénica. Debería considerarse cuando se quiere realizar un estudio exhaustivo de todos los genes relacionados con patología cardiovascular, especialmente en casos de muerte súbita en donde la información clínica o patológica es incompleta, o el diagnóstico no es claro.
En cuanto a la investigación, es una opción atractiva frente a los exomas, ya que incluye tanto genes de probada patogenicidad como genes candidatos. El estudio asegura una máxima rentabilidad con adecuadas coberturas (lo que permite evaluar variantes estructurales, como grandes deleciones y duplicaciones).
Se debería considerar la utilización de este panel:
- En el caso de cardiopatía congénita aislada.
- En el caso de cardiopatía congénita sindrómica relacionada con genes incluidos en el panel.
- En el caso de que se hayan descartado otras causas de cardiopatías congénitas (la presencia de anomalías cromosómicas, por ejemplo) mediante otro método, como SNP-arrays.
ACTA2 | ACTC1 | ACVR1 | ACVR2B |
ACVRL1 | ANKRD1 | B3GAT3 | BMPR2 |
BRAF | CBL | CFC1 | CITED2 |
COL1A1 | COL1A2 | COL3A1 | COL5A1 |
COL5A2 | CREBBP | CRELD1 | CHD7 |
DTNA | EFEMP2 | EHMT1 | ELN |
ENG | EP300 | EVC | EYA4 |
FBN1 | FBN2 | FLNA | FOXC1 |
FOXF1 | FOXH1 | FOXP1 | GAA |
GATA4 | GATA5 | GATA6 | GDF1 |
GJA1 | GJA5 | HAND2 | HRAS |
IRX4 | ISL1 | JAG1 | KANSL1 |
KCNA5 | KCNJ8 | KCNK3 | KMT2D |
KRAS | LEFTY2 | MAP2K1/MEK1 | MAP2K2 |
MCTP2 | MED12 | MED13L | MFAP5 |
MIB1 | MYBPC3 | MYH11 | MYH6 |
MYH7 | MYLK | NEXN | NF1 |
NKX2-5 | NKX2-6 | NODAL | NOTCH1 |
NOTCH2 | NOTCH3 | PHP4 | NRAS |
PDGFRA | PITX2 | PLOD1 | PRKG1 |
PTPN11 | RAF1 | RASA1 | RASA2 |
RIT1 | SALL4 | SHOC2 | SKI |
SLC2A10 | SMAD1 | SMAD3 | SMAD4 |
SMAD6 | SMAD9 | SOS1 | SOS2 |
SPRED1 | TAB2 | TBX1 | TBX20 |
TBX5 | TDGF1 | TFAP2B | TGFB2 |
TGFB3 | TGFBR1 | TGFBR2 | TNNI3 |
TNNI3K | TOPBP1 | UPF3B | ZDHHC9 |
ZFPM2 | ZIC3 |
Este panel incluye todos los genes asociados o potencialmente asociados al desarrollo de enfermedades cardiovasculares hereditarias, al igual que genes que se asocian a un mayor riesgo cardiovascular global. Se trata de un grupo de enfermedades heterogéneas, y el estudio genético permite el diagnóstico diferencial entre las mismas. También es de utilidad cuando se sospecha una etiología multigénica. Debería considerarse cuando se quiere realizar un estudio exhaustivo de todos los genes relacionados con patología cardiovascular, especialmente en casos de muerte súbita en donde la información clínica o patológica es incompleta, o el diagnóstico no es claro.
En cuanto a la investigación, es una opción atractiva frente a los exomas, ya que incluye tanto genes de probada patogenicidad como genes candidatos. El estudio asegura una máxima rentabilidad con adecuadas coberturas (lo que permite evaluar variantes estructurales, como grandes deleciones y duplicaciones).
- Personas con sospecha o diagnóstico clínico de una cardiopatía congénita sindrómica o no sindrómica (de presentación aislada). Ante un antecedente familiar de cardiopatía congénita en el que existe un riesgo de recurrencia, siempre es preciso intentar determinar la etiología molecular.
- Estudio familiar: familiares de pacientes con una cardiopatía congénita sindrómica o no sindrómica en los que se haya identificado previamente una mutación causal.
- Genetics of congenital heart disease: the glass half empty. Fahed AC, Gelb BD, Seidman JG, Seidman CE. Circ Res. 2013 Feb 15; 112(4):707-20.
- Genetic testing for long QT syndrome and the category of cardiac ion channelopathies. Modell SM, Bradley DJ, Lehmann MH. PLoS Curr. 2012 May 3.
Se recomienda descartar inicialmente anomalías cromosómicas (cariotipo, array de CGH, SNP-arrays) para mejorar el rendimiento del estudio, especialmente si existen otras malformaciones.
El panel de NGS permite identificar mutaciones en algunos de los genes asociados con el desarrollo de cardiopatías congénitas sindrómicas y no sindrómicas.
El análisis de casos utilizando la secuenciación de exoma completo puede considerarse en casos en los que se sospeche una causa genética de una cardiopatía congénita sin causa molecular identificada, pero la rentabilidad individual sobre nuestros paneles de NGS es escasa.
Enfoque diagnóstico:
En el caso de una cardiopatía congénita asociada a otras malformaciones, es posible que se trate de un síndrome genético. Por esta razón está indicado el estudio de cariotipo en caso de sospecha de alteraciones cromosómicas.
El análisis mediante SNP-arrays puede detectar variantes en el número de copias (CNVs) en todo el material genético, permitiendo confirmar o descartar síndromes de microdeleción o microduplicación, por ejemplo deleción 22q11 (Síndrome velocardiofacial), deleción 7q11 (Síndrome de Williams), etc.
El panel de NGS (secuenciación masiva) permite estudiar 114 genes relacionados con cardiopatías congénitas, ya sea para algunos síndromes monogénicos como Síndrome de Holt Oram (TBX5), Síndrome de Alagille (JAG1 y NOTCH2), Síndrome de CHARGE (CDH7), Síndrome de Rubinstein-Taybi (CREBBP Y EP300), RASopatías, Síndrome de Marfan (FBN1), entre otros; así como mutaciones en genes relacionados con cardiopatías congénitas no sindrómicas o aisladas.
Health in Code ofrece también la posibilidad de realizar estudios de secuenciación de exoma completo en casos en los que se sospeche una causa genética de una cardiopatía congénita sin causa molecular identificada, pero la rentabilidad adicional sobre nuestros paneles de NGS es escasa.